Fünf Jahre nach dem ersten Angriff der Urzeitechse Godzilla arbeitet eine US-Wissenschaftlerin und ihr Team erfolgreich an einer Möglichkeit, mit den Monstern zu kommunizieren. Doch dann bemächtigen sich terroristische Kräfte ihrer und ihrer Erfindung, was den Ex-Mann der Paleo-Biologin auf den Plan ruft, der seine Familie und zusammen mit dem Militär auch die Menschheit retten will.