Die von ihnen selbst gezeichneten Comic-Träume zweier Schulfreunde verselbstständigen sich in Gestalt eines hypnotisierten Schuldirektors, der als Superheld „Captain Underpants“ glaubt, die Stadt von Bösewichtern befreien zu können. Derweil mutiert ein als Lehrer angestellter verrückter Wissenschaftler zur „Turbo-Toilette 2000“ und bringt die Stadt tatsächlich in Gefahr.